O Governo assume  que o Simplex 2006 é "um programa piloto", que não obedece "a uma arquitectura desenhada e acabada, assente em metodologias rígidas e em articulações milimétricas entre todas medidas que inclui".

Pelo contrário,  no seu ano de lançamento, o Executivo pretende que o programa de simplificação administrativa e legislativa leve os serviços públicos a fazer o levantamento das respectivas interacções com os cidadãos e as empresas, avaliem "os custos e os encargos de cada uma delas" e questionem a sua "pertinência".

Durante 2006, será, assim, "definida e adoptada uma metodologia, com vista a uma avaliação mais sistemática dos encargos administrativos existentes, tanto para cidadãos como para empresas", lê-se no documento. Esta avaliação permitirá ao Executivo estabelecer "as prioridades de simplificação e os objectivos de redução de encargos para 2007 e assim sucessivamente nos anos seguintes".