Quando António Champalimaud faleceu, em 2003, deixou um património avaliado em mais de dois mil milhões, que foi repartido pelos cinco filhos e pelos cinco netos, descendentes dos filhos entretanto falecidos, António Carlos e João Henrique. No seu testamento, deixou 24,5% dos ativos para a criação da Fundação Champalimaud, que hoje tem uma carteira de investimentos de 425 milhões de euros.

A 25 de agosto de 2006, morreu ...