O Governo recebeu, em Julho de 2005, um documento que já denunciava o facto de as dificuldades económicas da Universidade Independente (UnI) estarem a prejudicar a sua oferta pedagógica, no caso concreto o curso de Psicologia, que foi objecto de avaliação externa pelo CNAVES (Conselho Nacional de Avaliação do Ensino Superior).

Ao contrário do que seria de esperar, o relatório não teve qualquer consequência por parte do Governo, segundo Adelina Lopes da Silva, presidente da comissão que analisou os cursos de Psicologia.

Esta informação contradiz a versão governamental de que "o "primeiro problema sério com a UnI" só surgiu em 2006, de acordo com as afirmações do ministro da Ciência, Tecnologia e Ensino Superior, em conferência de Imprensa na semana passada.